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田卫东
博士,教授,博士生导师,复旦大学医学遗传研究院兼职PI
地址:复旦大学生科楼G609
电话:021-31246723
邮箱:weidong.tian@fudan.edu.cn

学术任职

中国生物信息学会系统生物学专委会副主任,上海市遗传学会理事,上海市生物信息学学会理事,全国卫生生产企业管理协会精准医疗分会常务理事

教育经历

1995年上海交通大学本科,1998年清华大学硕士,2004年美国华盛顿大学(圣路易斯)博士,2005-2008年美国哈佛大学医学院博士后。

工作经历

2008年起复旦大学生命科学学院教授,博导,复旦大学遗传工程国家重点实验室PI,2009年起复旦大学附属儿科医院兼职PI,2018年起山东大学齐鲁儿童医院兼职PI。

所获人才项目

上海浦江人才,上海曙光学者

承担项目

1. 国家自然科学基金重大研究计划“微进化过程的多基因作用机制” (91231116),国家自然科学基金面上项目(32370719, 32170667, 31871325, 31671367, 31471245, 31071113, 30971643),负责人
2. 科技部“精准医学研究”重点专项“中国重大疾病与罕见病临床与生命组学数据库”项目(2017YFC0908402),负责人
3. 教育部博士点专项科研基金(博导类)(20120071110018),负责人
4. 上海教委曙光计划(13SG05),上海教委科研创新重大项目(13ZZ006),负责人
5. 上海浦江人才项目(09PJ1401000),负责人
6. 国家重点研发计划“病原学与防疫技术体系研究”重点专项“重要病原体复杂和多边免疫原的设计和优化研究”(2021YFC2301503),国家重大研发计划“生殖健康及重大出生缺陷防控研究”重点专项“中国人群重大出生缺陷的成因、机制和早期干预”项目(2016YFC1000505),国家自然科学基金重大研究计划“微进化过程的多基因作用机制”(91631301),国家973项目(2012CB316505,2010CB529505),骨干

主要研究方向

生物信息学方法开发和应用,包括疾病编码变异和非编码调控序列变异的筛选及临床表型数据分析的算法开发和应用,单细胞数据的分析方法开发和临床应用,RNA编辑和基因转录调控,生物通路和生物网络的分析方法开发和应用等。

代表论文及著作

1. Tian L, Xie Y, Xie Z, Tian J, Tian W#. (2023) AtacAnnoR: a reference-based annotation tool for single cell ATAC-seq data. Brief Bioinform 2023 Sep 20;24(5):bbad268. (PMID: 37497729)

2. Zhang Y, Zhang F, Wang Z, Wu S, Tian W#. (2022) scMAGIC: accurately annotating single cells using two rounds of reference-based classification. Nucleic Acids Research. 2022. May 6;50(8):e43.(PMID: 34986249)

3. Zhang, F., Li, X., Tian, W#. (2020) Unsupervised Inference of Developmental Directions for Single Cells Using VECTOR. Cell Reports. 2020 Aug 25;32(8):108069. (PMID: 32846127)

4. Zhang, F., Wu, Y., Tian, W#. (2019) A novel approach to remove the batch effect of single-cell data. Cell Discovery. 2019 Sep 24;5:46. doi: 10.1038/s41421-019-0114-x. (PMID: PMC6796914)

5. Li, Z., Zhang, F., Wang, Y., Qiu, Y., Wu, Y., Lu, Y., Yang, L., Qu, W.J., Wang, H., Zhou, W.#, and Tian W#.(2019) PhenoPro: A novel toolkit for assisting in the diagnosis of Mendelian diseases. Bioinformatics. 2019 Feb 19. pii: btz100. (PMID: 30843052)

6. 田卫东,赵兴明.《生物信息学与功能基因组学》化学工业出版社,2020年1月