学术任职

中华医学会医学信息分会副主任委员；中国研究型医院学会临床数据与样本资源库专业委员会副主任委员；中国中文信息学会理事会理事

教育经历

学士，北京大学（1984–1988）
硕士，中国科学院（1988–1991）
博士，美国康涅狄格大学（1991–1997）

工作经历

美国康涅狄格大学计算机科学与工程系博士后（1997-1999）
美国伊利诺伊大学（University of Illinois at Urbana-Champaign）生物技术中心生物信息学实验室主任（Director of Bioinformatics）（1999-2007）
美国伊利诺伊大学国家超级计算中心(National Center for Supercomputing Application, NCSA)研究员（Faculty Fellow）（2000-2007）
中国科学院上海生命科学院“百人计划”研究员、博士生导师（2007-2013）
复旦大学（附属）上海市公共卫生临床中心转化医学部主任（2014-2018）
上海生物信息技术研究中心副主任（2008-2020）
复旦大学上海医学院生物医学研究院研究员，博士生导师（2013-2020）
复旦大学大数据研究院医学信息与医学影像智能诊断研究所所长（2017-至今）
复旦大学上海医学院基础医学院教授，博士生导师（2020-至今）
复旦大学智能医学研究院常务副院长（2022-至今）

承担项目

1. 上海市“地高建”项目，复旦大学上海医学院医学科研数据中心，年度：2020-持续，项目负责人，经费：2879万
2. 国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项“疾病研究精准医学知识库构建”项目，年度：2016-2020，项目首席，经费：4632万
3. 国家863生物大数据开发与利用关键技术研究项目“组学大数据的质量控制与临床应用标准化研究”课题，年度：2015-2017；子任务负责人，经费：112万

主要研究方向

生物医学大数据：开发大数据平台，整合的临床资料数据、样本库信息和组学数据；文本挖掘；临床数据结构化；生物医学大数据挖掘
医学人工智能：生物医学知识库构建与本体研发；医学影像人工智能系统研发；临床决策支持系统研发；
生物信息学：组学数据分析，转录组数据分析，调控网络分析，系统动力学建模；测序分析等

代表论文

(1)Zhu C, Xia X, Li N, Zhong F*, Yang Z*, Liu L*. RDKG-115: Assisting Drug Repurposing and Discovery for Rare Diseases by Trimodal Knowledge Graph Embedding. Comput Biol Med. 2023; 164:107262.

(2)Xia X, Zhu C, Zhong F*, Liu L*. MDTips: A Multimodal-data based Drug-Target interaction prediction system fusing knowledge, gene expression profile and structural data. Bioinformatics. 2023; 39(7):btad411.

(3)Chen Y, Yao L, Zhao S, Xu M, Ren S, Xie L*, Liu L*, Wang Y*. The oxidative aging model integrated various risk factors in type 2 diabetes mellitus at system level. Front Endocrinol (Lausanne). 2023; 14:1196293.

(4)Li R, Zhou L*, Wang Y, Shan F, Chen X*, Liu L*. A graph neural network model for the diagnosis of lung adenocarcinoma based on multimodal features and an edge-generation network. Quant Imaging Med Surg. 2023; 13(8):5333-5348.

(5)Zhan K, Wang Y, Zhuo Y, Zhan Y, Yan Q, Shan F, Zhou L*, Chen X*, Liu L*. An uncertainty-aware self-training framework with consistency regularization for the multilabel classification of common computed tomography signs in lung nodules. Quant Imaging Med Surg. 2023; 13(9):5536-5554.